Para definir um estoque mínimo de algum produto, primeiro clique em Configurações, e depois Gerais

Depois ative a seguintes opção:

Desta forma, você poderá definir um estoque mínimo de algum produto, o que irá permitir que, quando realizar uma venda dele e ele estiver com a quantidade mínima, ou menor, o sistema te avise e a venda não seja concluída.